透明FPC作為一種柔性電路板，雖然具有許多優點，但也存在一些缺點：

1. 成本高：透明FPC的制作需要使用高透明的基材和導電材料，這些材料成本較高，導致透明FPC的成本也相對較高。

2. 加工難度大：透明FPC的加工需要精細的工藝和設備，對溫度、時間、環境等條件的要求也比較高，因此加工難度較大。

3. 可靠性問題：透明FPC的可靠性問題主要包括粘接問題、電鍍問題、切割問題、鉚合問題等，這些問題會影響透明FPC的性能和可靠性。

4. 尺寸穩定性差：由于透明FPC的材料和加工工藝等因素的影響，其尺寸穩定性相對較差，容易發生變形和尺寸變化。

5. 耐化學腐蝕性差：透明FPC的耐化學腐蝕性相對較差，容易受到化學物質的腐蝕。

綜上所述，透明FPC的缺點主要包括成本高、加工難度大、可靠性問題、尺寸穩定性差和耐化學腐蝕性差等。這些缺點可能會對透明FPC的應用和發展產生一定的限制和挑戰。